Pada tahun 2009, Majlis Agama Islam Negeri Kedah (MAIK) telah bersetuju untuk mewujudkan Unit Audit Dalam dalam jentera pentadbiran. Tujuan penubuhan Unit Audit Dalam bersesuaian dengan objektif Audit demi untuk mempertingkatkan lagi akauntabiliti dan ketelusan dalam operasi Majlis Agama Negeri Kedah.
Audit Dalam telah ditubuhkan sebagai satu Unit di Majlis Agama Islam Negeri Kedah dan ia mula beroperasi pada bulan Januari 2011. Unit ini dianggotai oleh seorang Penolong Juruaudit Dalam yang dilantik secara rasmi pada 3 Januari 2011. Bagi menjamin beliau mempunyai kebebasan dalam menjalankan kerja audit dalaman, beliau melapor terus kepada Yang Dipertua MAIK melalui Jawatankuasa Audit MAIK.